Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc172Q810N9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms