Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms