Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed4Q80WQ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbed4Q80WQ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms