Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL1

Tdrkh, Tudor and KH domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrkhQ80VL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TdrkhQ80VL1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TdrkhQ80VL1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TdrkhQ80VL1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms