Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube3cQ80U95 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3cQ80U95 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms