Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cep170bQ80U49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep170bQ80U49 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms