Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo1Q7TT28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo1Q7TT28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms