Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf7ipQ7TT18 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf7ipQ7TT18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms