Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ClmQ7TSN2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms