Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccp110Q7TSH4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms