Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Prrc2bQ7TPM1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms