Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg4Q7TMD7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg4Q7TMD7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg4Q7TMD7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms