Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp17leQ7M764 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp17leQ7M764 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17leQ7M764 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms