Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mvb12aQ78HU3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mvb12aQ78HU3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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