Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stambpl1Q76N33 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stambpl1Q76N33 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms