Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpopQ6ZWS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms