Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms