Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf3Q6ZQA6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms