Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg5Q6ZPY2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms