Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2oQ6ZPJ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms