Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a1Q6X893 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a1Q6X893 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms