Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2eQ6VUP9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms