Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300lfQ6SJQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lfQ6SJQ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms