Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt9Q6RHW0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms