Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfrkbQ6PIJ4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfrkbQ6PIJ4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms