Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms