Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx13Q6PHS6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms