Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup98Q6PFD9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms