Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtifQ6PEE2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtifQ6PEE2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms