Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdgfrlQ6PE55 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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