Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc36Q6PDM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc36Q6PDM4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms