Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dtx4Q6PDK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dtx4Q6PDK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dtx4Q6PDK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dtx4Q6PDK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms