Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc2Q6PDG5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms