Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc117Q6PB51 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms