Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc4Q6PAV2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc4Q6PAV2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 483.8 ms