Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BC061212Q6P8K3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BC061212Q6P8K3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
BC061212Q6P8K3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BC061212Q6P8K3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BC061212Q6P8K3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC061212Q6P8K3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms