Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W2

Shkbp1, SH3KBP1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shkbp1Q6P7W2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shkbp1Q6P7W2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shkbp1Q6P7W2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shkbp1Q6P7W2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms