Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp12Q6P5B0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rrp12Q6P5B0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms