Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam222bQ6P539 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam222bQ6P539 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms