Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg2aQ6P4T0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms