Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pprc1Q6NZN1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pprc1Q6NZN1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Pprc1Q6NZN1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Pprc1Q6NZN1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Pprc1Q6NZN1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pprc1Q6NZN1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pprc1Q6NZN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pprc1Q6NZN1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms