Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rad17Q6NXW6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rad17Q6NXW6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad17Q6NXW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms