Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SphkapQ6NSW3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SphkapQ6NSW3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms