Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mvb12bQ6KAU4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12bQ6KAU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms