Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm4Q6IRU2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms