Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt39Q6IFX4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms