Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Best3Q6H1V1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Best3Q6H1V1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Best3Q6H1V1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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