Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nckap5lQ6GQX2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms