Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Carmil1Q6EDY6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Carmil1Q6EDY6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Carmil1Q6EDY6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Carmil1Q6EDY6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms