Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep290Q6A078 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep290Q6A078 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms